一、操作難易

自然分蜂是指等蜂群分蜂后再將分蜂群收捕回來，操作時只要養蜂人能及時將分蜂群收捕回來即可，而人工分蜂是指蜂群尚未分蜂時便對蜂群進行人工拆分，這就需要養蜂人掌握一定的技術才能完成，因此單從操作難易上看自然分蜂比人工分蜂稍微簡單些。

二、可控程度

自然分蜂在一定程度上幾乎是不可控的，從蜂群中出現王臺開始任何時候都可能發生，而人工分蜂完全可自由決定分蜂時間，只要蜂群中有成熟的王臺即可進行，因此在可控程度上人工分蜂完勝自然分蜂，尤其是在分蜂期自然分蜂絕對會讓養蜂人手忙腳亂。

三、是否回蜂

自然分蜂完全是蜂群自然發生的分蜂行為，相對極少出現回蜂(分出去的工蜂回到原巢)情況，而人工分蜂是養蜂人強制進行的分蜂，倘若分蜂時操作不慎時很容易出現回蜂現象，尤其是分蜂距離過近時更為普遍，因此從是否回蜂上看自然分蜂相對要好一些。

四、蜂群發展

自然分蜂是蜂群發展到一定規模后的自然行為，分蜂后兩群蜂都能自然發展并快速恢復群勢，而人工分蜂是養蜂人強制將蜂群一分為二，若分蜂時間把握不到位容易出現回蜂，從而導致分蜂群很難發展起來，另外對分蜂群的育蟲、采集等行為也有一定影響。

總結：自然分蜂好還是人工分蜂好并沒有定論，其中在分蜂技術不熟練時自然分蜂要好些，而熟練掌握分蜂技術后人工分蜂更便捷，另外當蜂場規模較大時建議選擇人工分蜂。